癌癥的發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,涉及環(huán)境因素、生活方式以及遺傳等多方面影響。近日,西北工業(yè)大學(xué)在癌癥風(fēng)險基因準(zhǔn)確識別方面取得新突破,為未來腎透明細(xì)胞癌癥靶向治療提供新的分子依據(jù)和藥物研發(fā)方向。

腎透明細(xì)胞癌是最常見的腎細(xì)胞癌亞型。傳統(tǒng)癌癥風(fēng)險基因識別方法主要基于突變頻率識別風(fēng)險基因,但某些關(guān)鍵驅(qū)動基因在腎透明細(xì)胞癌患者中突變頻率較低,并且由于癌癥的遺傳基礎(chǔ)極其多樣,不同患者間的突變模式存在顯著差異,基于突變頻率的方法和無監(jiān)督方法在泛化性和準(zhǔn)確性上受限。目前已知的腎透明細(xì)胞癌高可信風(fēng)險基因數(shù)量有限,限制了這類方法的識別準(zhǔn)確率。

為解決以上難題,西工大計算機(jī)學(xué)院科學(xué)智能交叉研究中心研究團(tuán)隊提出了一種基于深度強(qiáng)化學(xué)習(xí)的計算方法RL-GenRisk,用于識別腎透明細(xì)胞癌的風(fēng)險基因。在研究團(tuán)隊所設(shè)計的獎勵機(jī)制引導(dǎo)下,模型能夠自動學(xué)習(xí)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)參數(shù),從而解決了監(jiān)督學(xué)習(xí)方法受限于有限標(biāo)簽數(shù)據(jù)的挑戰(zhàn)。實驗結(jié)果表明,這種計算方法能夠更準(zhǔn)確地識別腎透明細(xì)胞癌的風(fēng)險基因。RL-GenRisk識別出了一些潛在的腎透明細(xì)胞癌風(fēng)險基因。據(jù)介紹,研究團(tuán)隊通過生物實驗成功驗證了EGFR和PCLO兩個基因,發(fā)現(xiàn)抑制這兩個基因的表達(dá)都能夠顯著抑制腎透明細(xì)胞癌的進(jìn)展,表明RL-GenRisk所識別出的風(fēng)險基因具有作為ccRCC潛在治療靶點(diǎn)的潛力,可以為未來ccRCC癌癥靶向治療提供新的分子依據(jù)和藥物研發(fā)方向。

據(jù)悉,該團(tuán)隊相關(guān)研究成果論文已經(jīng)在國際期刊《Nature Communications》發(fā)表。西北工業(yè)大學(xué)計算機(jī)學(xué)院博士研究生鹿大智、天津大學(xué)副教授鄭巖和四川大學(xué)博士生易賢顏翎為該論文共同第一作者,天津大學(xué)郝建業(yè)教授、四川大學(xué)艾建忠研究員和西北工業(yè)大學(xué)彭佳杰教授為共同通訊作者。

責(zé)任編輯:黃蕊